Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRIT2A6NDA9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms