Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC144AA2RUR9 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms