Protein–RNA interactions for Protein: A2RRP1

NBAS, Neuroblastoma-amplified sequence, humanhuman

Predictions only

Length 2,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBASA2RRP1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NBASA2RRP1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms