Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
E2F8A0AVK6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
E2F8A0AVK6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms