Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAB39Q9Y376 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CAB39Q9Y376 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms