Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATP8A1Q9Y2Q0 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms