Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DTX4Q9Y2E6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms