Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRAPPC4Q9Y296 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms