Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNQ9UQP3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms