Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MED13Q9UHV7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MED13Q9UHV7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms