Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
DKK2Q9UBU2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
DKK2Q9UBU2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms