Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF7Q9UBF6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF7Q9UBF6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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RNF7Q9UBF6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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