Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EHD3Q9NZN3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EHD3Q9NZN3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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