Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNK4Q9NYG8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms