Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CNTLNQ9NXG0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms