Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPMQ9NSP4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPMQ9NSP4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms