Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAB18Q9NP72 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms