Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SEMA4CQ9C0C4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SEMA4CQ9C0C4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms