Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT23

LIMD2, LIM domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD2Q9BT23 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LIMD2Q9BT23 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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