Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDHD3Q9BSH5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDHD3Q9BSH5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDHD3Q9BSH5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDHD3Q9BSH5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDHD3Q9BSH5 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDHD3Q9BSH5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDHD3Q9BSH5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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HDHD3Q9BSH5 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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HDHD3Q9BSH5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HDHD3Q9BSH5 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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