Protein–RNA interactions for Protein: Q99616

CCL13, C-C motif chemokine 13, humanhuman

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL13Q99616 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CCL13Q99616 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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CCL13Q99616 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCL13Q99616 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCL13Q99616 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCL13Q99616 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCL13Q99616 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCL13Q99616 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCL13Q99616 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCL13Q99616 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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CCL13Q99616 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CCL13Q99616 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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