Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PKP4Q99569 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms