Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VAT1Q99536 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms