Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NBPF4Q96M43 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NBPF4Q96M43 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms