Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NMD3Q96D46 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms