Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MCOLN3Q8TDD5 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms