Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM71DQ8N9W8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FAM71DQ8N9W8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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