Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
LINC00612Q8N6U2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms