Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LNX2Q8N448 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LNX2Q8N448 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms