Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PBRM1Q86U86 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PBRM1Q86U86 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms