Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ATG4DQ86TL0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ATG4DQ86TL0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms