Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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