Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
WDR53Q7Z5U6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms