Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VSTM1Q6UX27 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VSTM1Q6UX27 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms