Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TSSK4Q6SA08 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms