Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
FRMPD1Q5SYB0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FRMPD1Q5SYB0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms