Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SLC27A3Q5K4L6 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A3Q5K4L6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms