Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PAN3Q58A45 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PAN3Q58A45 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PAN3Q58A45 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms