Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CCDC38Q502W7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC38Q502W7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms