Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC25A52Q3SY17 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms