Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC27Q2M243 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC27Q2M243 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms