Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Q1T7F1 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
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