Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
FAM187BQ17R55 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms