Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZNF239Q16600 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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