Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SLC18A3Q16572 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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