Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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RPE65Q16518 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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RPE65Q16518 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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RPE65Q16518 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RPE65Q16518 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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