Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
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VPS72Q15906 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS72Q15906 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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