Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SCN9AQ15858 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
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