Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ALX1Q15699 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ALX1Q15699 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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