Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
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SF3A1Q15459 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SF3A1Q15459 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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SF3A1Q15459 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
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SF3A1Q15459 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SF3A1Q15459 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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